Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VGFO15240 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VGFO15240 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VGFO15240 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VGFO15240 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VGFO15240 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VGFO15240 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VGFO15240 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VGFO15240 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VGFO15240 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VGFO15240 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VGFO15240 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms