Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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