Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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TMOD3Q9NYL9 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TMOD3Q9NYL9 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TMOD3Q9NYL9 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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TMOD3Q9NYL9 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TMOD3Q9NYL9 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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