Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms