Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PHACTR1Q9C0D0 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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