Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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