Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms