Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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CHCHD4Q8N4Q1 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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