Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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