Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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