Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FXNQ16595 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FXNQ16595 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FXNQ16595 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FXNQ16595 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FXNQ16595 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FXNQ16595 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms