Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCAQ16586 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms