Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SGCBQ16585 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SGCBQ16585 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SGCBQ16585 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SGCBQ16585 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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