Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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