Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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