Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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