Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms