Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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