Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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