Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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