Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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