Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PUM3Q15397 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PUM3Q15397 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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