Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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