Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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SHPRHQ149N8 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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SHPRHQ149N8 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SHPRHQ149N8 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SHPRHQ149N8 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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