Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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