Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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NEDD9Q14511 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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NEDD9Q14511 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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