Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms