Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CNGB1Q14028 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms