Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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