Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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TCIRG1Q13488 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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TCIRG1Q13488 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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TCIRG1Q13488 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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TCIRG1Q13488 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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TCIRG1Q13488 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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