Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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MKRN4PQ13434 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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