Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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