Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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