Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms