Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms