Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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