Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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