Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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