Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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