Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KCNMA1Q12791 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms