Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms