Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPREB1P12018 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms