Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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