Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms