Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ARXQ96QS3 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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