Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD1Q8NHV4 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms