Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD42Q8N9B4 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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