Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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KNOP1Q1ED39 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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KNOP1Q1ED39 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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