Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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