Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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